安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)工程研究所成立于2008年11月，前身為1995年7月成立的安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院原子能農(nóng)業(yè)應(yīng)用研究所，為省直農(nóng)業(yè)科研院所、獨(dú)立法人、公益一類事業(yè)單位，位于安徽省會(huì)合肥市。主要從事農(nóng)業(yè)微生物、農(nóng)業(yè)廢棄物資源化利用、農(nóng)業(yè)機(jī)械、農(nóng)業(yè)規(guī)劃與咨詢服務(wù)等方面的科學(xué)研究和技術(shù)服務(wù)，擁有國家發(fā)改委規(guī)劃咨詢乙級資質(zhì)和乙級資信單位資格?，F(xiàn)有科研人員33人，其中高級職稱18人，二級研究員1人、三級研究員2人，博士10人，享受國務(wù)院津貼2人、省政府津貼2人，安徽省學(xué)術(shù)和技術(shù)帶頭人3人，安徽省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系崗位專家6人。

安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)微生物研究與應(yīng)用創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)主要從事農(nóng)業(yè)微生物菌種選育與菌群構(gòu)建、農(nóng)業(yè)廢棄物厭氧利用技術(shù)研究，現(xiàn)有職工7人，其中，高級以上職稱2人，博士3人。近三年來，團(tuán)隊(duì)建立了安徽省農(nóng)業(yè)微生物省級菌種保藏管理中心、國家農(nóng)用微生物太和觀測試驗(yàn)點(diǎn)等科研平臺(tái)，建立了厭氧微生物長期觀測點(diǎn)2處、肥效微生物長期觀測點(diǎn)1處；開發(fā)的秸稈發(fā)酵墊料生態(tài)養(yǎng)豬專用菌劑、高溫好氧堆肥菌劑在省內(nèi)多地成功推廣；建設(shè)鄉(xiāng)村振興示范村2處；團(tuán)隊(duì)牽頭組織了安徽省第一次農(nóng)業(yè)微生物種質(zhì)資源普查和資源保護(hù)單位確認(rèn)工作。

安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)裝備創(chuàng)新研發(fā)團(tuán)隊(duì)現(xiàn)有成員6人，其中博士1人、碩士5人，高級職稱1人。團(tuán)隊(duì)主要從事農(nóng)業(yè)機(jī)械與設(shè)施裝備優(yōu)化改進(jìn)與設(shè)計(jì)研發(fā)。近年來，先后主持承擔(dān)了國家、?。ú浚┘?、市（廳）級等科研項(xiàng)目50余項(xiàng)；榮獲中華農(nóng)業(yè)科技獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)2項(xiàng)，安徽省科技進(jìn)步獎(jiǎng)三等獎(jiǎng)1項(xiàng)，省級科技成果2項(xiàng)；發(fā)表學(xué)術(shù)論文30余篇，授權(quán)國家專利35項(xiàng)，其中發(fā)明專利4項(xiàng)，獲得計(jì)算機(jī)軟件著作權(quán)13項(xiàng)；主持制定安徽省地方標(biāo)準(zhǔn)2項(xiàng)。